Die SATA kannst du einstecken, wo du willst. Ich hatte noch nie einen Fall, wo die Reihenfolge etwas ausgemacht hatte. Es gibt aber natürlich oft SATA-Slots, die im Bios aktiviert werden müssen. Mein Board hat zum Beispiel zwei Raid-Controller. Da kann man die Platten natürlich nicht in die Slots stecken, die für den zweiten Raidcontroller reserviert sind, ohne ihn im Bios zu aktivieren. Solche Slots sind aber normal gekennzeichnet.
Aber vertausch sie am Board doch einfach mal nach Belieben.