Achso.
Das Problem mit Skinner ist kein Problem...
Geh in deinen Interface/Addons/Skinner Ordner. Dort findest du den Ordner AddonSkins, welcher jede Menge Dateien enthält. Such nun die Dateien, die bei dir dort im Chat angezeigt werden (z.B. AtlasLoot, BugSack, Cartographer) und kopiere sie in den Ordner SkinMe (Interface/Addons/Skinner/SkinMe).
Dadurch bekommen die Addons auch einen Skin verpasst und die "Fehlermeldungen" sollten nicht mehr kommen.
-edit-
Im übrigen sagt dir der Fehler nicht dass das Verzeichnis SkinMe nicht vorhanden ist, sondern dass die Dateien im Verzeichnis SkinMe nicht vorhanden sind