Also generell kann man jede Karte, egal ob Ati oder auch Nvidia, so lang einzeln und nicht im Verbund, auf jedes Board setzen, welches eben eine PCI-Express-Schnittstelle anbietet. So die Theorie. In der Praxis kann es aber sehr wohl zu Problemen kommen. Mein Gigabyte P45 DS4 akzeptierte die ATI4870 erst nach Biosupdate. Zuvor gab es eine Rebootschleife, sobald ich nur den ATI-Treiber aufgespielt hatte und die Karte als 4870 erkannt wurde. Inkompatiblitäten kann es also immer geben, auch wenn es eigentlich passen sollte.
Was ich im Falle von euch aber eher vermute ist, daß ihr im Bios nicht richtig konfiguriert habt. Du sagst ja selber, daß eine Onboard-Grafiklösung vorhanden war. Ist die im Bios auch deaktiviert worden. Normal sollte das von allein erkannt werden, ist aber nicht die Regel. Bei manchen Chipsätzen kann man auch konfigurieren, daß beide Grafikkarten benutzt werden. Die Onboard dann im Desktop-Betrieb und die Steckkarte für Spiele etc...
Würde aber bei einer Onboard-Nvidia-Karte nur funktionieren, wenn man auch als Steckkarte eine Nvidia einsetzt, soweit ich weiß. Deswegen lief dann wohl auch die Nvidia. Ich behaupte also mal ganz frech, daß ihr da im Bios was vergeigt habt.